此次更名的药物有（括号内为新名称）：11．玉屏风散（玉屏风颗粒）、26．莲花清瘟胶囊（连花清瘟胶囊）、44．胃气止痛丸（良附丸）、54．蜜炼川贝批杷膏（蜜炼川贝枇杷膏）、60．精制咳嗽痰喘丸（京制咳嗽痰喘丸）62．紫雪散（紫雪颗粒）78．生脉饮颗粒（生脉饮）、100．愈凤宁心片（愈风宁心片）133．尫痹颗粒（尪痹颗粒）141．大柴胡丸（小柴胡汤丸）153．京万红烫伤膏（京万红）、156．紫草油膏（紫草油）、178．骨痛贴膏（骨通贴膏）、187．妇科痛经丸（妇女痛经丸）、194．野菊花栓剂（野菊花栓）、197．妇炎康栓剂（妇炎康栓）、207．小儿感冒冲剂（小儿感冒颗粒）、208．保婴丹（保婴散）、210．导赤丹（导赤丸）、214．小儿止咳化痰冲剂（小儿化痰止咳冲剂）、229．西瓜霜粉剂（桂林西瓜霜）．此外，在参考目录中删除了45．桑螵蛸散、161．鸡眼膏两种药物．同时，新更名的良附丸变更为医保药物。
《社区卫生服务机构用药参考目录》于2007年9月6日由卫生部和国家中医药治理局印发，目的是保证社区卫生服务机构基本用药，规范社区诊疗行为。